Essendo uno dei siti reali spagnoli, il palazzo, il monastero e la basilica di San Lorenzo de El Escorial hanno avuto molteplici funzioni nel corso della storia e sono ancora in uso oggi.
La domenica mattina la basilica viene utilizzata per celebrare le funzioni liturgiche, quindi tienilo presente quando acquisti i biglietti per San Lorenzo de El Escorial se vuoi entrare.
Gli scopi precedenti del complesso includono la residenza reale del Re di Spagna, un luogo di culto e un luogo di sepoltura per i reali spagnoli. Nel corso dei secoli, la struttura è servita anche come biblioteca, università, museo e ospedale.